<沿革>
1988年 韓国の大学生宣教会（CCC）と釜山東莱中央教会（大韓イエス教長老会統合派）から派遣された宣教師が東京で宣教活動を開始
1988年10月 淀橋教会（当時は日本キリスト教団、現在はウェスレアン・ホーリネス教団）の韓国部がヨハン東京キリスト教会として独立
1996年5月 教団神学校「日本宣教神学院（JMTS）」の前身である日本宣教センター（JMTC）設立
1996年〜現在 各都道府県の中心都市において教会を開拓してきました。
2013年5月 海外韓人長老会（Korean Presbyterian Church Abroad）に加入
2015年 教団名をヨハン教会連合から日本宣教連合会に改称
2023年6月 日本福音同盟（JEA）に加盟